GPdI Narwastu didirikan atas dasar kerinduan dari seorang Hamba Tuhan yang terpanggil untuk menjadi Gembala, setelah berkecimpung dalam dunia pelayanan selama bertahun-tahun, yaitu Pdt. Isye Theresia Margaret Thenu, S.Th. Oleh kemurahan, penyertaan, anugerah dan perkenanan Tuhan, GPdI Narwastu mengadakan Ibadah Perdananya pada tanggal 11 September 2011 yang akhirnya ditetapkan menjadi tanggal berdirinya GPdI Narwastu, bertempat di Hotel Amos Cozy, Jl. Melawai Raya, Blok M, Jakarta Selatan, dengan jumlah jemaat awal sekitar 30 orang. Mengalami berbagai tantangan dan pergumulan dalam pelayanan penggembalaan, Pdt. Isye T.M. Thenu menjalani tugasnya sebagai Gembala Jemaat atas pertolongan Tuhan dan kuat kuasa Roh Kudus. GPdI Narwastu tetap berdiri, ditopang oleh jemaat yang cinta melayani dan cinta pekerjaan Tuhan. Dengan suasana kekeluargaan, GPdI Narwastu melayani jemaat dalam berbagai kegiatan pastoral seperti pelayanan pernikahan, baptisan, penyerahan anak, penghiburan dan pemakaman, ibadah rumah tangga, pelayanan konseling dan kunjungan, dan tentunya Ibadah Raya setiap hari Minggu, Ibadah Doa, serta Ibadah setiap Komisi (Wanita, Pria, Pemuda & Remaja, Sekolah Minggu). GPdI Narwastu juga mengadakan berbagai kegiatan non pastoral seperti pelatihan musik dan multimedia. Saat ini jemaat GPdI Narwastu berjumlah sekitar 80 orang.
Tanggal 17 November 2022 yang lalu, Ibu Gembala kami, Pdt. Isye T.M. Thenu, harus berpulang kembali ke pangkuan Bapa di Surga, meskipun di saat-saat terakhirnya masih aktif melayani sebagai Gembala maupun sebagai Hamba Tuhan yang terlibat dalam berbagai kegiatan organisasi, baik organisasi GPdI (Komisi Wilayah Jakarta Selatan dan Komisi Daerah DKI Jakarta) juga melalui persekutuan-persekutuan doa.
Untuk melanjutkan tugas beliau sebagai Gembala Jemaat GPdI Narwastu, tanggal 19 November 2022, telah dilantik Gembala yang baru, yaitu Pdm. Sharon Meilany Yudadibrata, MBA, M.Pd., M.Th., yang merupakan anak tunggal dari Pdt. Isye T.M. Thenu. Pdm. Sharon Yudadibrata juga telah aktif menopang pelayanan ibunda di GPdI Narwastu, selain itu juga terlibat dalam berbagai kegiatan organisasi GPdI khususnya di bidang sekolah minggu, remaja dan pemuda.